Ne zna se ko ga je, a ni kada osnovao, ali postoje određeni podaci o manastiru u blizini Novog Pazara, koji svedoče o tome koliki je njegov značaj bio u različitim istorijskim periodima.
Manastir Crna Reka postaje opštežiteljni zahvaljujući Svetom Joanikiju Devičkom, koji se u njemu podvizivao. Postoje pretpostavke da je još u periodu nakon Kosovskog boja na tom mestu postojala ova svetinja.
Pa ipak, kao najbitniji podatak za istoriju manastira uzima se onaj koji datira iz druge polovine 17. veka. U to doba je manastir...